Protein–RNA interactions for Protein: Q5U5Q3

MEX3C, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEX3CQ5U5Q3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MEX3CQ5U5Q3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEX3CQ5U5Q3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MEX3CQ5U5Q3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms