Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SGO2Q562F6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SGO2Q562F6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms