Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBPF1Q3BBV0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF1Q3BBV0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
NBPF1Q3BBV0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms