Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRFIP1Q32MZ4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRFIP1Q32MZ4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms