Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NPTX1Q15818 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NPTX1Q15818 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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