Protein–RNA interactions for Protein: Q15435

PPP1R7, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R7Q15435 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R7Q15435 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R7Q15435 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R7Q15435 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R7Q15435 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PPP1R7Q15435 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms