Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NCF4Q15080 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NCF4Q15080 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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