Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COL9A3Q14050 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COL9A3Q14050 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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