Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CUL1Q13616 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CUL1Q13616 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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