Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRPF4BQ13523 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRPF4BQ13523 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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