Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TCIRG1Q13488 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TCIRG1Q13488 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
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