Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXE3Q13461 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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