Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1H3Q13133 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1H3Q13133 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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