Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
MRPL28Q13084 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
MRPL28Q13084 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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