Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RAB40BQ12829 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RAB40BQ12829 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms