Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TWF1Q12792 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TWF1Q12792 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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