Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NUP160Q12769 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NUP160Q12769 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP160Q12769 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP160Q12769 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP160Q12769 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP160Q12769 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP160Q12769 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP160Q12769 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP160Q12769 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP160Q12769 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP160Q12769 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NUP160Q12769 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms