Protein–RNA interactions for Protein: Q12303

YPS3, Aspartic proteinase yapsin-3, yeastyeast

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS3Q12303 BCH1YMR237W 2175 nt2.66□□□□□ -1.98
YPS3Q12303 ATP25YMR098C 1839 nt2.65□□□□□ -1.98
YPS3Q12303 TFC1YBR123C 1950 nt2.65□□□□□ -1.98
YPS3Q12303 HUL5YGL141W 2733 nt2.65□□□□□ -1.98
YPS3Q12303 TSC13YDL015C 933 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 SRB7YDR308C 423 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 RPN9YDR427W 1182 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 SPT2YER161C 1002 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 RSM27YGR215W 333 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 CTK2YJL006C 972 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YLR202CYLR202C 327 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 RDN58-1RDN58-1 158 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 RDN58-2RDN58-2 158 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 GLO1YML004C 981 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 RPS10AYOR293W 318 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 ATG5YPL149W 885 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 SEC15YGL233W 2733 nt2.65□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 STP2YHR006W 1626 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 TFB2YPL122C 1542 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 SNU23YDL098C 585 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 snR83snR83 306 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 PTI1YGR156W 1278 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YGR190CYGR190C 366 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 DOG1YHR044C 741 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 COX6YHR051W 447 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 PFS1YHR185C 714 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 DAL2YIR029W 1032 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 GCD14YJL125C 1152 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 IME1YJR094C 1083 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 REC102YLR329W 795 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YLR416CYLR416C 399 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 MRPL17YNL252C 846 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YOR152CYOR152C 771 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YPL068CYPL068C 882 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 PCI8YIL071C 1335 nt2.64□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 VPS17YOR132W 1656 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 MDM1YML104C 3384 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YHR080CYHR080C 4038 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YML096WYML096W 1578 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YEL010WYEL010W 351 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 RPS23AYGR118W 438 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 PET54YGR222W 882 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YIL024CYIL024C 570 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 FIP1YJR093C 984 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YJR128WYJR128W 360 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YKL123WYKL123W 381 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 RHO5YNL180C 996 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 PEX11YOL147C 711 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 snR11snR11 258 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 HHF1YBR009C 312 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 SYC1YOR179C 567 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 RPS23BYPR132W 438 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 RRP15YPR143W 753 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YBR287WYBR287W 1284 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 VTC4YJL012C 2166 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 EMP70YLR083C 2004 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 PIN4YBL051C 2007 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 SHQ1YIL104C 1524 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YGR237CYGR237C 2358 nt2.63□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 EXO5YBR163W 1758 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 SAG1YJR004C 1953 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 GRX2YDR513W 432 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YDR535CYDR535C 501 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 LSM4YER112W 564 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YER165C-AYER165C-A 357 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YIR023C-AYIR023C-A 324 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 SNX4YJL036W 1272 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 RPS21BYJL136C 264 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 NBP1YLR457C 960 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 IMP1YMR150C 573 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 DUG3YNL191W 1074 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 LOA1YPR139C 903 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 CDH1YGL003C 1701 nt2.62□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 UBP8YMR223W 1416 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 AKR1YDR264C 2295 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 GWT1YJL091C 1473 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 RRP42YDL111C 798 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 LRS4YDR439W 1044 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YGL006W-AYGL006W-A 111 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YIP5YGL161C 933 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 OST5YGL226C-A 261 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 AIM18YHR198C 966 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 COQ9YLR201C 783 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 SFH1YLR321C 1281 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YNL013CYNL013C 378 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 CIN8YEL061C 3003 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 SPO71YDR104C 3738 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt2.61□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YDL180WYDL180W 1644 nt2.6□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 UTP5YDR398W 1932 nt2.6□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 RIF1YBR275C 5751 nt2.6□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 YDR029WYDR029W 315 nt2.6□□□□□ -1.99
YPS3Q12303 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.3 ms