Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SOX4Q06945 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SOX4Q06945 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms