Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATXN1P54253 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATXN1P54253 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms