Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HK3P52790 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HK3P52790 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HK3P52790 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HK3P52790 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HK3P52790 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HK3P52790 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HK3P52790 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HK3P52790 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HK3P52790 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HK3P52790 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HK3P52790 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HK3P52790 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HK3P52790 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
HK3P52790 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HK3P52790 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HK3P52790 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HK3P52790 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HK3P52790 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HK3P52790 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HK3P52790 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HK3P52790 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HK3P52790 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HK3P52790 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HK3P52790 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HK3P52790 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HK3P52790 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HK3P52790 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HK3P52790 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HK3P52790 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HK3P52790 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HK3P52790 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HK3P52790 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HK3P52790 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HK3P52790 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HK3P52790 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HK3P52790 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HK3P52790 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HK3P52790 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HK3P52790 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HK3P52790 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HK3P52790 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HK3P52790 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HK3P52790 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HK3P52790 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HK3P52790 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HK3P52790 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HK3P52790 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HK3P52790 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HK3P52790 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HK3P52790 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 447 ms