Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BRCA2P51587 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
BRCA2P51587 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms