Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBP50607 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBP50607 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBP50607 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBP50607 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBP50607 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBP50607 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBP50607 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBP50607 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBP50607 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBP50607 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBP50607 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBP50607 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBP50607 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBP50607 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBP50607 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBP50607 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBP50607 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBP50607 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBP50607 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBP50607 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBP50607 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBP50607 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBP50607 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBP50607 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBP50607 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBP50607 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBP50607 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBP50607 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBP50607 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBP50607 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBP50607 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBP50607 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBP50607 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBP50607 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms