Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TM4SF4P48230 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF4P48230 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF4P48230 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms