Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIA4P48058 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIA4P48058 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms