Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PTGER2P43116 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PTGER2P43116 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms