Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Tnfsf9P41274 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Tnfsf9P41274 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Tnfsf9P41274 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tnfsf9P41274 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tnfsf9P41274 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms