Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP8P40818 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP8P40818 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP8P40818 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP8P40818 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP8P40818 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP8P40818 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP8P40818 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP8P40818 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP8P40818 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP8P40818 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP8P40818 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP8P40818 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP8P40818 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP8P40818 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP8P40818 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP8P40818 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP8P40818 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP8P40818 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP8P40818 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP8P40818 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP8P40818 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
USP8P40818 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP8P40818 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP8P40818 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP8P40818 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP8P40818 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP8P40818 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP8P40818 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP8P40818 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP8P40818 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP8P40818 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP8P40818 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP8P40818 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms