Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT9P35527 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT9P35527 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT9P35527 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT9P35527 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT9P35527 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT9P35527 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KRT9P35527 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT9P35527 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT9P35527 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT9P35527 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT9P35527 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT9P35527 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KRT9P35527 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KRT9P35527 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KRT9P35527 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KRT9P35527 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KRT9P35527 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT9P35527 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT9P35527 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT9P35527 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT9P35527 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT9P35527 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT9P35527 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT9P35527 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT9P35527 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KRT9P35527 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KRT9P35527 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms