Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTFRP26992 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CNTFRP26992 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms