Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2B4P23634 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2B4P23634 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2B4P23634 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2B4P23634 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2B4P23634 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP2B4P23634 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP2B4P23634 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP2B4P23634 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms