Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARF4P18085 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARF4P18085 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF4P18085 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF4P18085 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF4P18085 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF4P18085 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF4P18085 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARF4P18085 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARF4P18085 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARF4P18085 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARF4P18085 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARF4P18085 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF4P18085 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARF4P18085 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF4P18085 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF4P18085 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF4P18085 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARF4P18085 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARF4P18085 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF4P18085 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF4P18085 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF4P18085 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARF4P18085 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms