Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTPS1P17812 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTPS1P17812 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTPS1P17812 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CTPS1P17812 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTPS1P17812 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTPS1P17812 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTPS1P17812 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTPS1P17812 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTPS1P17812 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTPS1P17812 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms