Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF2P15336 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF2P15336 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF2P15336 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF2P15336 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF2P15336 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF2P15336 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF2P15336 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF2P15336 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF2P15336 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF2P15336 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF2P15336 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF2P15336 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF2P15336 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF2P15336 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF2P15336 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF2P15336 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF2P15336 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF2P15336 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF2P15336 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF2P15336 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF2P15336 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF2P15336 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF2P15336 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF2P15336 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATF2P15336 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATF2P15336 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF2P15336 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF2P15336 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF2P15336 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF2P15336 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF2P15336 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF2P15336 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF2P15336 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF2P15336 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF2P15336 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF2P15336 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF2P15336 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF2P15336 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF2P15336 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF2P15336 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF2P15336 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATF2P15336 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF2P15336 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF2P15336 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF2P15336 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF2P15336 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF2P15336 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF2P15336 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF2P15336 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF2P15336 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF2P15336 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF2P15336 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF2P15336 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATF2P15336 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATF2P15336 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATF2P15336 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATF2P15336 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms