Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
UBE4BO95155 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBE4BO95155 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms