Protein–RNA interactions for Protein: O15016

TRIM66, Tripartite motif-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM66O15016 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM66O15016 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM66O15016 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms