Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DFFAO00273 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DFFAO00273 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DFFAO00273 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DFFAO00273 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DFFAO00273 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DFFAO00273 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DFFAO00273 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DFFAO00273 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DFFAO00273 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DFFAO00273 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DFFAO00273 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DFFAO00273 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DFFAO00273 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DFFAO00273 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DFFAO00273 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DFFAO00273 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DFFAO00273 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DFFAO00273 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DFFAO00273 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DFFAO00273 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DFFAO00273 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DFFAO00273 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DFFAO00273 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DFFAO00273 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DFFAO00273 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DFFAO00273 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DFFAO00273 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms