Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3E1

Aldh3b2, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B2, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b2E9Q3E1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Aldh3b2E9Q3E1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b2E9Q3E1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms