Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem238A9JSM3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem238A9JSM3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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