Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC12A4Q9UP95 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC12A4Q9UP95 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms