Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GTF3C4Q9UKN8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GTF3C4Q9UKN8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms