Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AFF4Q9UHB7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AFF4Q9UHB7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms