Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBP1Q9NZI7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBP1Q9NZI7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBP1Q9NZI7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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