Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FBXO8Q9NRD0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FBXO8Q9NRD0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FBXO8Q9NRD0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FBXO8Q9NRD0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FBXO8Q9NRD0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
FBXO8Q9NRD0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO8Q9NRD0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO8Q9NRD0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO8Q9NRD0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO8Q9NRD0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FBXO8Q9NRD0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms