Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARHGEF4Q9NR80 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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