Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
HOXD1Q9GZZ0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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HOXD1Q9GZZ0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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HOXD1Q9GZZ0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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