Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
REXO4Q9GZR2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
REXO4Q9GZR2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms