Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snx5Q9D8U8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms