Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
2310003L06RikQ9CV82 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
2310003L06RikQ9CV82 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms