Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRNKL1Q9BZJ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRNKL1Q9BZJ0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
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